1、阴茎折断
部分男性性生活时动作过于激烈或不正确的姿势，可能引起阴茎折断，从而引起剧烈疼痛感。手术治疗畸形阴茎，性生活时也会有疼痛。
2、生殖器官感染
男性患有生殖器官感染发炎时可引起性交疼痛，如尿道炎、尿道下裂、精囊炎和前列腺炎等均会引起性交疼痛。
3、弓形阴茎
阴茎沟部和颈部溃疡，愈后会留下疤痕，性生活时阴茎因为充血勃起而导致牵引疼痛。
4、生殖器病变
包皮过长或包茎的人，阴茎头冠部会积累太多污垢，对阴茎皮肤带来刺激，引起局部过敏或发炎，性生活时势必会有疼痛感。
5、避孕因素
部分男性属于过敏体质，阴茎皮肤对胶质避孕套和避孕膏过敏，可引起过敏性皮炎，性生活时会出现摩擦性疼痛。另外女性避孕器械异位可能会触及阴茎而引起性交疼痛。